糸球体は、腎臓の中で血液をろ過する「ふるい」としてはたらきます。IgA腎症は、IgAの異常によってこの糸球体に炎症が起こる病気です。IgAに異常が生じると、その異常なIgAが血液中で免疫複合体(めんえきふくごうたい)と呼ばれるかたまりを作ります。この免疫複合体が腎臓の糸球体に沈着すると、補体(ほたい)と呼ばれる免疫のしくみが活性化され、炎症を起こす物質が放出され、炎症が起こります。炎症が長く続くと糸球体の組織がダメージを受け、腎臓の機能が徐々に低下していきます。